Polipeptid peptid zanjirining konstruktiv sxemasi va eritmasi

I. Xulosa
Peptidlar maxsus makromolekulalar bo'lib, ularning ketma-ketligi kimyoviy va fizik xususiyatlarida g'ayrioddiy.Ba'zi peptidlarni sintez qilish qiyin, boshqalarni sintez qilish nisbatan oson, ammo tozalash qiyin.Amaliy muammo shundaki, ko'pchilik peptidlar suvli eritmalarda ozgina eriydi, shuning uchun bizning tozalashimizda hidrofobik peptidning tegishli qismi suvsiz erituvchilarda eritilishi kerak, shuning uchun bu erituvchilar yoki tamponlar foydalanishga jiddiy mos kelmaydigan bo'lishi mumkin. biologik eksperimental protseduralar, shuning uchun texnik xodimlarga peptidni o'z maqsadlari uchun ishlatish qat'iyan man etiladi, shuning uchun quyida tadqiqotchilar uchun peptidlarni loyihalashning bir necha jihatlari mavjud.

Polipeptid peptid zanjirining konstruktiv sxemasi va eritmasi
Ikkinchidan, sintetik qiyin peptidlarni to'g'ri tanlash
1. Pastga regulyatsiya qilingan ketma-ketliklarning umumiy uzunligi
15 dan kam qoldiq bo'lgan peptidlarni olish osonroq, chunki peptid hajmi kattalashadi va xom mahsulotning tozaligi pasayadi.Peptid zanjirining umumiy uzunligi 20 ta qoldiqdan oshib ketganligi sababli, mahsulotning aniq miqdori asosiy tashvish hisoblanadi.Ko'pgina tajribalarda qoldiq sonini 20 dan pastga tushirish orqali kutilmagan effektlarni olish oson.
2. Hidrofobik qoldiqlar sonini kamaytiring
Hidrofobik qoldiqlarning katta ustunligi bo'lgan peptidlar, ayniqsa mintaqada C-terminusdan 7-12 qoldiq, odatda sintetik qiyinchiliklarni keltirib chiqaradi.Bu etarli bo'lmagan kombinatsiya sifatida ko'riladi, chunki sintezda B qatlamli varaq olinadi."Bunday holatlarda ikkitadan ortiq ijobiy va salbiy qoldiqlarni aylantirish yoki peptid tarkibini ochish uchun peptidga Gly yoki Pro qo'yish foydali bo'lishi mumkin."
3. "Qiyin" qoldiqlarni pastga tushirish
"Bir qator Cys, Met, Arg va Try qoldiqlari mavjud bo'lib, ular odatda osonlikcha sintez qilinmaydi."Ser odatda Cys ga oksidlovchi bo'lmagan muqobil sifatida ishlatiladi.
Polipeptid peptid zanjirining konstruktiv sxemasi va eritmasi

Uchinchidan, suvda eriydiganlarni to'g'ri tanlashni yaxshilash
1. N yoki C terminalini sozlang
Kislotali peptidlarga nisbatan (ya'ni, pH 7 da manfiy zaryadlangan), atsetillanish (N-terminus atsetilatsiyasi, C terminali har doim erkin karboksil guruhini saqlab turadi) manfiy zaryadni oshirish uchun ayniqsa tavsiya etiladi.Biroq, asosiy peptidlar uchun (ya'ni, pH 7 da musbat zaryadlangan) musbat zaryadni oshirish uchun aminatsiya (N-terminusdagi erkin aminokislota va C-terminusdagi aminatsiya) ayniqsa tavsiya etiladi.

2. Ketma-ketlikni juda qisqartiring yoki uzaytiring

Ba'zi ketma-ketliklarda Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr va Ala va boshqalar kabi ko'p sonli hidrofobik aminokislotalar mavjud. Ushbu hidrofobik qoldiqlar 50% dan oshganda, ularni eritish odatda oson emas.Peptidning ijobiy va salbiy qutblarini yanada oshirish uchun ketma-ketlikni uzaytirish foydali bo'lishi mumkin.Ikkinchi variant - hidrofobik qoldiqlarni kamaytirish orqali ijobiy va salbiy qutblarni oshirish uchun peptid zanjirining hajmini kamaytirishdir.Peptid zanjirining ijobiy va salbiy tomonlari qanchalik kuchli bo'lsa, suv bilan reaksiyaga kirishish ehtimoli shunchalik yuqori bo'ladi.
3. Suvda eriydigan qoldiqga soling
Ba'zi peptid zanjirlari uchun ba'zi ijobiy va manfiy aminokislotalarning kombinatsiyasi suvda eruvchanligini oshirishi mumkin.Kompaniyamiz kislotali peptidlarning N-terminali yoki C-terminalini Glu-Glu bilan birlashtirishni tavsiya qiladi.Asosiy peptidning N yoki C terminali, keyin esa Lys-Lys berildi.Agar zaryadlangan guruhni joylashtirish imkoni bo'lmasa, Ser-Gly-Ser N yoki C terminaliga ham joylashtirilishi mumkin.Biroq, peptid zanjirining tomonlarini o'zgartirish mumkin bo'lmaganda, bu yondashuv ishlamaydi.