Transmembran peptidlarning ko'p turlari mavjud va ularning tasnifi fizik va kimyoviy xususiyatlar, manbalar, yutish mexanizmlari va biotibbiyotda qo'llanilishiga asoslanadi.Fizikaviy va kimyoviy xossalariga ko'ra membranadan o'tuvchi peptidlarni uch turga bo'lish mumkin: katyonik, amfifil va hidrofobik.Kation va amfifil membranadan o'tuvchi peptidlar 85% ni tashkil qiladi, hidrofobik membrana penetratsion peptidlar esa atigi 15% ni tashkil qiladi.
1. Kationik membranadan o'tuvchi peptid
Kationik transmembran peptidlari TAT, Penetratin, Poliarginin, P22N, DPV3 va DPV6 kabi arginin, lizin va histidinga boy qisqa peptidlardan iborat.Ular orasida arginin tarkibida guanidin mavjud bo'lib, u hujayra membranasidagi manfiy zaryadlangan fosfor kislotasi guruhlari bilan vodorod bog'lanishi va fiziologik PH qiymati sharoitida membrana transmembran peptidlarini vositachilik qilishi mumkin.Oligargininni (3 R dan 12 R gacha) o'rganish shuni ko'rsatdiki, membrana kirib borish qobiliyati arginin miqdori 8 ga kam bo'lgandagina erishiladi va arginin miqdori ortishi bilan membrana penetratsion qobiliyati asta-sekin o'sib boradi.Lizin, arginin kabi katyonik bo'lsa ham, guanidinni o'z ichiga olmaydi, shuning uchun u yolg'iz mavjud bo'lganda, uning membrana kirish samaradorligi unchalik yuqori emas.Futaki va boshqalar.(2001) yaxshi membrana penetratsiyasi ta'siriga faqat katyonik hujayra membranasi penetratsion peptid tarkibida kamida 8 ta musbat zaryadlangan aminokislotalar mavjud bo'lganda erishish mumkinligini aniqladi.Ijobiy zaryadlangan aminokislotalar qoldiqlari penetratsion peptidlarning membranaga kirib borishi uchun zarur bo'lsa-da, boshqa aminokislotalar ham bir xil darajada muhimdir, masalan, W14 F ga mutatsiyaga uchraganda, Penetratinning penetratsion qobiliyati yo'qoladi.
Kationik transmembran peptidlarning maxsus klassi yadroviy lokalizatsiya ketma-ketligi (NLSs) bo'lib, arginin, lizin va prolinga boy qisqa peptidlardan iborat bo'lib, yadro gözenek kompleksi orqali yadroga o'tkazilishi mumkin.NLSlarni yana bitta va ikkilamchi tipga bo'lish mumkin, ular mos ravishda asosiy aminokislotalarning bir va ikkita klasteridan iborat.Misol uchun, simian virusi 40 (SV40) dan PKKKRKV bitta tipli NLS, yadro oqsili esa ikkilamchi NLS hisoblanadi.KRPAATKKAGQAKKKL - membrana transmembranasida rol o'ynashi mumkin bo'lgan qisqa ketma-ketlik.Aksariyat NLS larning zaryad raqamlari 8 dan kam bo'lganligi sababli, NLS samarali transmembran peptidlari emas, lekin ular amfifil transmembran peptidlarini hosil qilish uchun hidrofobik peptidlar ketma-ketligi bilan kovalent bog'langanda samarali transmembran peptidlari bo'lishi mumkin.
2. Amfifil transmembran peptid
Amfifil transmembran peptidlari birlamchi amfifil, ikkilamchi a-spiral amfifil, b-qatlamli amfifil va prolin bilan boyitilgan amfifillarga bo'linadigan gidrofil va hidrofobik domenlardan iborat.
Birlamchi turdagi amfifil aşınma membran peptidlari MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKRKV) va Pep-1 (KETWWETWWWTEWSQPKKRKV) kabi hidrofobik peptidlar ketma-ketligi bilan kovalent bog'langan NLSli toifaga ega bo'lgan ikkita toifaga bo'linadi. MPG domeni OIV glikoproteini 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) sintezi ketma-ketligi bilan bog'liq va Pep-1 ning hidrofobik domeni yuqori membrana yaqinligi (KETWWET WWTEW) bo'lgan triptofanga boy klaster bilan bog'liq.Biroq, ikkalasining hidrofobik domenlari WSQP orqali PKKKRKV yadroviy lokalizatsiya signali bilan bog'langan.Birlamchi amfifil transmembran peptidlarining yana bir klassi pVEC, ARF (1-22) va BPrPr (1-28) kabi tabiiy oqsillardan ajratilgan.
Ikkilamchi a-spiral amfifil transmembran peptidlari membrana bilan a-spirallar orqali bog'lanadi va ularning gidrofil va hidrofobik aminokislota qoldiqlari MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) kabi spiral strukturaning turli sirtlarida joylashgan.Beta peptidli katlama tipidagi amfifil aşınma membranasi uchun uning beta qatlamli qatlam hosil qilish qobiliyati membrananing penetratsion qobiliyatini o'rganish jarayonida VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTVTGKGDPKPD) kabi membrananing penetratsion qobiliyati uchun juda muhim, D turidan foydalangan holda. - aminokislota mutatsiyasining analoglari beta katlamli bo'lak hosil qila olmadi, membrananing penetratsion qobiliyati juda zaif.Prolin bilan boyitilgan amfifil transmembran peptidlarida prolin polipeptid strukturasida yuqori darajada boyitilgan bo'lsa, poliprolin II (PPII) toza suvda osongina hosil bo'ladi.PPII - har bir burilishda 3,0 aminokislota qoldig'i bo'lgan chap qo'lli spiral, standart o'ng qo'lli alfa-spiral tuzilishidan farqli o'laroq, har bir burilishda 3,6 aminokislota qoldig'i.Prolin bilan boyitilgan amfifil transmembran peptidlari sigir mikroblarga qarshi peptid 7 (Bac7), sintetik polipeptid (PPR) n (n 3, 4, 5 va 6 bo'lishi mumkin) va boshqalarni o'z ichiga oladi.
3. Gidrofobik membranadan o'tuvchi peptid
Gidrofobik transmembran peptidlari faqat qutbsiz aminokislota qoldiqlarini o'z ichiga oladi, sof zaryad aminokislotalar ketma-ketligining umumiy zaryadining 20% dan kam bo'ladi yoki transmembran uchun muhim bo'lgan hidrofobik qismlar yoki kimyoviy guruhlarni o'z ichiga oladi.Ushbu hujayra transmembran peptidlari ko'pincha e'tibordan chetda qolsa-da, ular fibroblast o'sish omili (K-FGF) va Kaposi sarkomasidan fibroblast o'sish omili 12 (F-GF12) kabi mavjud.
Xabar vaqti: 2023-yil 19-mart