Hujayraga o'tuvchi peptidlar kichik peptidlar bo'lib, ular hujayra membranasiga osongina kirib boradi.Ushbu molekula sinfi, ayniqsa maqsadli funktsiyalarga ega CPPlar, maqsadli hujayralarga samarali dori etkazib berish uchun va'da beradi.
Shuning uchun bu boradagi tadqiqotlar ma'lum biotibbiy ahamiyatga ega.Ushbu tadqiqotda turli xil transmembran faolligiga ega bo'lgan CPPlar ketma-ketlik darajasida o'rganildi, CPPlarning transmembran faolligiga ta'sir qiluvchi omillarni, turli xil faollikdagi CPPlar va NonCPPs o'rtasidagi ketma-ketlik farqlarini aniqlashga harakat qilindi va biologik ketma-ketliklarni tahlil qilish usulini joriy qildi.
CPPs va NonCPPs ketma-ketliklari CPPsite ma'lumotlar bazasidan va turli adabiyotlardan olingan va yuqori, o'rta va past transmembran faolligi bo'lgan transmembran peptidlari (HCPPs, MCPPs, LCPPs) ma'lumotlar to'plamlarini yaratish uchun CPPs ketma-ketliklaridan olingan.Ushbu ma'lumotlar to'plamiga asoslanib, quyidagi tadqiqotlar o'tkazildi:
1, turli faol CPPs va NonCPPs aminokislotalar va ikkilamchi tuzilish tarkibi ANOVA tomonidan tahlil qilindi.Aminokislotalarning elektrostatik va hidrofobik o'zaro ta'siri CPP'larning transmembran faolligida muhim rol o'ynaganligi va spiral tuzilishi va tasodifiy o'ralishi CPP'larning transmembran faolligiga ham ta'sir qilgani aniqlandi.
2. Ikki o'lchovli tekislikda turli xil faoliyatga ega CPPlarning fizik va kimyoviy xossalari va uzunligi ko'rsatildi.Turli xil faoliyatga ega CPPs va NonCPPs ba'zi bir maxsus xususiyatlar ostida klasterlangan bo'lishi mumkinligi aniqlandi va HCPPs, MCPPs, LCPPs va NonCPPs uchta klasterga bo'lingan va ularning farqlarini ko'rsatgan;
3. Ushbu maqolada biologik ketma-ketlikning fizik-kimyoviy sentroidi tushunchasi kiritiladi va ketma-ketlikni tashkil etuvchi qoldiqlar zarracha nuqtalari sifatida qaraladi va ketma-ketlik tadqiqot uchun zarrachalar tizimi sifatida abstraktlashtiriladi.Ushbu usul turli xil faoliyatga ega CPPlarni PCA usuli bo'yicha 3D tekisligiga proyeksiya qilish orqali CPPlarni tahlil qilishda qo'llanildi va ko'pchilik CPPlar birgalikda va ba'zi LCPPlar NonCPPs bilan birga klasterlanganligi aniqlandi.
Ushbu tadqiqot CPPlarni loyihalash va turli faoliyat bilan CPPlar ketma-ketligidagi farqlarni tushunishga ta'sir qiladi.Bundan tashqari, ushbu maqolada keltirilgan biologik ketma-ketliklarning fizik-kimyoviy centroidini tahlil qilish usuli boshqa biologik muammolarni tahlil qilish uchun ham qo'llanilishi mumkin.Shu bilan birga, ular ba'zi biologik tasniflash muammolari uchun kirish parametrlari sifatida ishlatilishi mumkin va naqshni aniqlashda rol o'ynaydi.
Yuborilgan vaqt: 2023 yil 15-iyun